为了使无尘室内保持所需要的温度、湿度、风速、压力和洁净度等参数，最常用的方法是向室内不断送入一定量经过处理的空气，以消除无尘室内外各种热湿干扰及尘埃污染，为获得送入无尘室具有一定状态的空气，就需要一整套设备对空气进行处理，并不断送入室内，又不断从室内排出一部分来，这一整套设备就构成了净化空调系统。
一、净化空调系统的基本构成
净化空调系统所用的设备按作用大致可分为三类:
1、加热或冷却，加湿或去湿以及净化设备。
2、将处理后的空气送入各无尘室并使之循环的空气输送设备及其管路。
3、向系统提供热量，冷量的热、冷源及其管路系统。
二、净化空调系统的分类
净化空调系统一般分为三大类：
1、集中式净化空调系统
在系统内单个或多个洁净室所需的净化空调设备都集中在机房内，用送风管道将洁净空气配给各个无尘室。
2、分散式净化空调系统
在系统内各个无尘室分别单独设置净化设备或净化空调设备。
3、半集中式净化空调系统
在这种系统中，即有集中的净化空调机房，又有分散在各无尘室内的空气处理设备，是一种集中处理和局部处理相结合的形式。
人们一般按系统内各无尘室的洁净度来命名系统，如称之为100级净化空调系统，1000级净化空调系统等。
有时也按系统的末级过滤器的性质来区分，分为高效空气净化系统，亚高效空气净化系统和中效空气净化系统。（下图为空调机组示意图）
三、净化空调系统的消毒方法
注意：消毒前确认洁净区内所有人员已经撤出，生产处于停止状态。
1.臭氧消毒
消毒方式为臭氧发生器产生一定浓度臭氧，由风机风管带入洁净区内进行消毒。臭氧消毒一般在无人情况下进行，目前我国药厂都是沿用臭氧对空调通风系统进行消毒。公共场所为人群聚集的场所，一般不选用单独的臭氧消毒方法。
2.紫外线消毒
紫外线照射对静止的物体或空气消毒具有十分可靠的效果, 但紫外线穿透性较差, 遮挡角落不易被消毒; 且紫外线没有除尘作用，空气中的尘埃粒子可能会影响其消毒效果。